莽白决定铲除永历随行官员，派人通知永历朝臣过江议事。鉴于双方关系紧张，南明文武官员心怀疑惧都不敢前往。缅王又遣人来说，此去只是缅王邀请群臣饮咒水盟誓，以增强双方的信任，否则关系断绝，永历君臣处境将更为艰难。在缅方坚持下，马吉翔提出要由黔国公沐天波一同前往方可。沐氏世代镇守云南，是明朝西南边境各邦国较为重视的人物，马吉翔认为有沐天波在场，不会发生意外。

次日，马吉翔及其他大小官员参加饮咒水盟誓。文武官员一到达盟誓地点就遭到缅兵攻击，被骗来饮咒水的官员全部遇难，自以为入缅便可保安全的马吉翔也丢了性命。

缅军随即突入永历君臣住所，把永历帝、太后、皇后、太子等25人集中于一所小屋内。永历帝的刘、杨二贵人，吉王与妃妾等百余人大都自缢而死。为防永历帝自尽，缅王又遣人前来抚慰，送来一些生活用品，幸存人员方得苟延残喘。咒水之难后，永历帝真正成了孤家寡人，永历朝廷实际已不存在。

孤家寡人仍难逃一死

永历帝留在缅甸，终究是一个祸患。1660年，吴三桂几次上疏清廷，力主入缅进讨，清廷采纳了吴三桂的意见，派出八旗兵由北京前往云南，会同吴三桂一起进兵缅甸，捉拿永历帝。

随着清政权的逐步稳固，缅甸政府也不愿为收留南明流亡政权而得罪中国的实际统治者。李定国等明朝将领为迎回永历帝一再与缅方兵戎相见，清军又将入境进讨，使得缅甸政府不得不为本国的安全考虑。顺治十八年（1661）正月初六，缅王派使者到云南，提出以交出永历帝为条件请清军合攻李定国。吴三桂立刻答应了缅方的请求。咒水之难后，新缅王实际上把永历帝当作与清廷讨价还价的筹码。

顺治十八年（1661）八月二十四日，吴三桂率兵由昆明分两路西进。不久，清军迫近缅都，缅王派人将永历帝及其随从移交给清军。吴三桂随即撤出缅境。

康熙元年（1662）三月，永历帝及其眷属被押回云南昆明。吴三桂认为若押解回北京，路途十分遥远，担心发生意外，建议就地处决，清廷准奏。四月，永历帝被处死。南明永历朝廷至此烟消云散。