“一大”闭幕后，马林虽未与陈独秀谋面，但他对陈独秀作为共产党领导人在资产阶级政府中做官是不满的。尤其是他作为共产国际代表来中国这么长时间，陈独秀居然不来见他，简直不把共产国际和自己放在眼里，至于其他在上海的中共党员如李达等人，每当马林提出有关工作计划设想时，则托词等陈独秀返沪后再作决定而予以抵制。由于中共一开始就没有接受共产国际的经费援助，所以“一大”后经费短缺再次成为中共面临的首要问题。每月虽只用二三百元，但还是难以筹措，李达等人只好函告陈独秀，请他设法筹集经费。鉴于这种情况，8月马林在与张国焘商谈成立中国劳动组合书记部时，再次表示要向中共提供活动经费，他说:“站在国际主义的立场，共产国际有帮助各国共产党的义务，而中共也应坦然接受。”马林还要求张国焘立即编制工作计划和经费预算。按张国焘的预算，“总共预计有30人按月领取生活津贴，每人约需20元至35元。这个机构全部开支及出版费用每月约需1000多元。”马林见所需经费如此少，大笑着表示同意，决定全部经费都由共产国际补贴，中共自己所筹集的经费可作为它用。但此后中共中央讨论此事时，决定把这“视为一个试行的草案，等陈独秀先生返沪后再作最后决定”，再一次拒绝了共产国际提供经费援助的要求。

马林碰了钉子后，急切地盼望能早日与陈独秀会面。为此，他曾专门召集张国焘、李达、包惠僧等人开会，讨论陈独秀回上海的问题。会上马林不满地说:“陈独秀先生当选为中国共产党中央局书记，应当回到上海，尽到责任，不能由别人代替，国际上没有这样的先例。”于是，会议决定派包惠僧去广东接陈独秀迅速回上海主持党中央工作。马林对包惠僧说:“包先生，你要对陈独秀先生讲清楚，要他回上海，不仅是中国党的意思，也是我的意思。”随后不久，包惠僧就去广州接陈独秀回上海。

摩擦和争吵

包惠僧一到广州就向陈独秀详细汇报了党的“一大”情况，并说:“上海方面及马林，要先生尽早回上海主持工作。”陈独秀说:“当初是为了推进广东革命而南下，现在共产党成立，当然不能久留广州，是该回上海了。”包惠僧还向陈独秀谈到上海党员与马林的关系，陈独秀明显站在国内同志一边，对马林不太满意。9月11日，陈独秀辞职后与包惠僧乘船离粤回沪，在谈到共产国际时说，“我们没有必要靠它，现在我们还没有阵地，以后工作展开了再找第三国际联系。”包惠僧说:“陈先生，马林说过中国共产党从成立起，就编入第三国际，是国际的一个支部。”陈独秀听后十分反感，说道:“他们承认与否没有用！要靠中国人自己组织党，中国革命要靠中国人自己干，要一面工作，一面革命。”